Dünyada Diclonius adı verilen yeri bir insan türü ortaya çıkmıştır. Kafasının üzerinde boynuz gibi kemiler, ve "görünmez elleri" bulunan bu canlılar tehlikeye düştüklerini hissettikleri anda tam bir ölüm makinesine dönüşebildikleri için Kamakura Adası'ndaki özel bir tesiste kontrol altında tutulmaktadırlar. İnsan ırkını Diclonius tehdidinden korumak amacıyla doğan Dicloniuslar'ı doğar doğmaz öldürme kararı alan devlet bir yandan da yakaladıkları Dicloniuslar'ın üzerinde korkunç deneyler yapmaktadır. Bu deneklerden biri de Lucy adında genç bir kızdır. Tesisten kaçmayı başaran Lucy iki üniversite öğrencisi tarafından bulunur ve mera başlar.
